Qua xử lý dữ liệu kết quả tuyển sinh ĐH 2004, Trung tâm Tin học của Bộ GD&ĐT đã thông báo tới Thanh tra Bộ GD&ĐT về một danh sách gồm 90 trường hợp có nghi vấn trong thi cử. Trong danh sách đó cứ từng cặp 2 người trùng họ tên đệm và tên, cùng giới tính, cùng ngày tháng năm sinh, cùng hộ khẩu thường trú (phạm vi quận/huyện), cùng trường THPT và cùng năm tốt nghiệp THPT song lại có kết quả thi ở 2 trường ĐH trong cùng một đợt thi.
Nhận được thông báo đó, Thanh tra Bộ GD&ĐT đã gửi công văn tới 40 trường ĐH, CĐ liên quan yêu cầu gửi những tài liệu cần thiết về Bộ GD&ĐT để xác minh. Kết quả xác minh cho thấy: Có 80 trường hợp không phát hiện dấu hiệu sai phạm; 8 trường hợp được khẳng định là có gian lận; 2 trường hợp vẫn cần phải tiếp tục xác minh.
Về 80 trường hợp không phát hiện dấu hiệu sai phạm thì có 8 thí sinh (4 cặp trùng khít các thông số cá nhân) theo tài liệu của Trung tâm Tin học không có tháng và năm sinh. 8 thí sinh này đều dự thi ở trường ĐH Sư phạm Hà Nội 2 (Xuân Hoà). Trong báo cáo của ĐH SPHN 2 thì 8 thí sinh này có ngày tháng năm sinh khác nhau. Trường ĐH SPHN 2 cũng khẳng định 8 thí sinh này là 8 người khác nhau. Có 72 thí sinh (mang 36 cặp tên) thì cơ quan thanh tra đã đối chiếu từng cặp hồ sơ và chưa phát hiện thấy dấu hiệu sai phạm.
Về 8 thí sinh (4 cặp tên) được khẳng định là có gian lận cụ thể như sau. Trường hợp thứ nhất là có 2 thí sinh cùng tên dự thi vào 2 trường: ĐH Công đoàn (không đỗ) và ĐH Sư phạm Hà Nội (đỗ) - đều cùng đợt. Khi tổ công tác Thanh tra xuống ĐH SPHN thì sinh viên nghi phạm này đã bỏ trốn (đến nay chưa trở lại trường). Tổ công tác đã yêu cầu trường ĐH SPHN tiếp tục xử lý SV này và làm rõ người thi hộ.
Trường hợp thứ hai là 1 cặp thi vào Viện ĐH Mở HN (không đỗ), ĐH DL Phương Đông (đỗ). Trường ĐHDL Phương Đông đã ra quyết định buộc SV gian lận đó thôi học, nhưng lại vẫn chưa khai thác được thông tin gì về người thi hộ.
Trường hợp thứ ba là 1 cặp thi vào ĐH Ngoại thương và ĐH Luật HN (đều không đỗ). Thanh tra Bộ GD&ĐT đã có công văn đề nghị công an địa phương mà “cặp” thí sinh này thường trú để xử lý.
Trường hợp thứ tư là 1 cặp dự thi vào Học viện Tài chính (đỗ, đang theo học tại trường) và ĐH Mỏ - Địa chất (đỗ, song không theo học). Đối chiếu chữ viết của sinh viên đang theo học ở trường HV Tài chính và thí sinh dự thi vào HV Tài chính không thấy khác nhau. Qua đó chứng tỏ người dự thi vào HV Tài chính và người đang học ở trường này là một.
Qua điều tra được biết, “cặp” này là chị và em gái ruột (đang là học sinh THPT) của nhau. Xét tình tiết có nhiều yếu tố giảm nhẹ, thực tế là thí sinh thật có kết quả thật, còn “thí sinh giả” không hưởng lợi gì từ kết quả thi nên Thanh tra Bộ GD&ĐT đang đề nghị Bộ GD&ĐT công nhận kết quả thi tuyển sinh và cho SV “thi thật” đó được học bình thường tại HV Tài chính. Việc xử lý kỷ luật “thí sinh giả” (đang học THPT) được giao cho Sở GD&ĐT địa phương.
Về 2 trường hợp (1 cặp trùng tên) đang chờ xác minh tiếp thì đều có hộ khẩu thường trú ở một địa phương thuộc Đồng bằng sông Cửu Long. Các trường mà 2 thí sinh này dự thi cũng ở khu vực phía Nam.