Ông Tuấn chỉ đạo thu nhiều khoản phí vượt qui định hoặc chi sai mà không được công khai, minh bạch trước cha mẹ học sinh vào đầu năm học mới 2015-2016.
Ngoài việc bị kỷ luật, ông Nguyễn Mạnh Tuấn phải hoàn trả cho cha mẹ học sinh hơn 140 triệu đồng. Trong thời gian bị phát hiện, ông Nguyễn Mạnh Tuấn không được tái bổ nhiệm lại dù đã hết thời hạn.