Tỷ lệ thanh toán, nộp tiền điện tử qua ngân hàng phối hợp thu, Kho bạc Nhà nước hiện nay chiếm khoảng 90% trong tổng số tiền thuế ngành Hải quan nộp vào ngân sách nhà nước.
Mục tiêu chính của đề án nhằm tạo thuận lợi tối đa cho người nộp thuế có thể nộp tiền mọi lúc, mọi nơi, mọi phương tiện, hạn chế tối đa việc thanh toán bằng tiền mặt; đảm bảo thông tin nộp tiền được thanh khoản thuế kịp thời, chính xác; giảm thời gian nộp thuế, đồng thời thông quan hàng hóa ngay sau khi nộp thuế, qua đó rút ngắn thời gian hoàn thành thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu của doanh nghiệp xuống bằng mức trung bình của nhóm nước ASEAN-4 theo chỉ đạo của Chính phủ.
Trước mắt, Tổng cục Hải quan sẽ cho người nộp thuế cập nhật thông tin chữ ký số, làm thủ tục ủy quyền ngân hàng trích nợ tài khoản khi nộp tiền theo phương thức lập chứng từ nộp thuế tại Cổng thanh toán điện tử Hải quan. Dự kiến ngày 15/9/2017, người nộp thuế có thể cập nhật thông tin trên vào chương trình.
