Ngày 25/5/2005, Cơ quan cảnh sát điều tra Công an tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu đã khởi tố vụ án, khởi tố bị can và ra lệnh bắt tạm giam đối với bà Phan Thị Thường về tội “Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản”.
Sau đó, ngày 21/11/2005, Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu quyết định truy tố bà Thường về tội danh trên. Hai tháng sau, Toà án Nhân dân tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu đã tuyên phạt bà Thường 14 năm tù về tội “Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản” và buộc phải bồi thường cho nguyên đơn là bà Phan Thị Thanh Huyền (em ruột bà Thường) gần 900 triệu đồng.
Sau đó, bà Thường đã kháng cáo và ngày 19/6/2006, tòa phúc thẩm Toà án Nhân dân tối cao đã hủy bản án sơ thẩm để cấp sơ thẩm điều tra xét xử lại. Đến ngày 5/2/2007, Toà án Nhân dân tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu xét xử lại vụ án và tuyên bố bà Phan Thị Thường không phạm tội, đồng thời trả tự do cho bà Thường.
Sau khi tuyên án, bà Phan Thị Thanh Huyền đã kháng cáo bản án, đồng thời Viện Kiểm sát Nhân dân tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu cũng kháng nghị vụ án theo hướng xác định bà Phan Thị Thường có tội.
Tuy nhiên, ngày 18/4/2007, tòa phúc thẩm Toà án Nhân dân tối cao đã xét xử và tuyên bố bà Phan Thị Thường không phạm tội và trả tự do cho bà Thường.
