Theo kết quả điều tra ban đầu xác định, từ năm 2012 đến 2016, lợi dụng chức vụ, quyền hạn được giao, ông Lê Văn Phước đã cùng với Trương Công Lộc (phụ trách kế toán TAND tỉnh), Huỳnh Thị Nhà Nhàn (thủ quỹ TAND tỉnh) và Ngô Thị Phương Thảo lập khống chứng từ kế toán, chiếm đoạt nguồn tiền do UBND tỉnh hỗ trợ công tác tập huấn Hội thẩm nhân dân, xét xử lưu động và kinh phí do TAND tối cao cấp cho TAND tỉnh phục vụ chi tiền lương, kinh phí khác phục vụ cho hoạt động cho TAND tỉnh với số tiền trên 1 tỷ đồng, chia nhau để sử dụng cá nhân.

Liên quan đến vụ án ngày,  ông Trương Công Lộc và bà Huỳnh Thị Nhã Nhàn đã bị khởi tố trước đó cùng hành vi tham ô tài sản. Riêng ông Lộc đã bị bắt tạm giam. Trong quá trình điều tra, ông Lộc đã khai những người tòng phạm.

Được biết, cuối tháng 12/2017, ông Lê Văn Phước đã có đơn xin nghỉ việc để chữa bệnh và đã được TAND Tối cao chấp thuận cho ông thôi giữ chức chánh án TAND tỉnh Phú Yên vào đầu tháng 1/2018.