Mặt khác, một số doanh nghiệp, đối tượng buôn lậu vì mục tiêu lợi (kể cả lợi nhuận không hợp pháp) bằng mọi thủ đoạn móc nối, mua chuộc cán bộ, công chức hải quan… để làm trái quy định của pháp luật nhằm trốn thuế, buôn lậu. Đây là môi trường dễ làm cho một bộ phận cán bộ, công chức Hải quan nảy sinh lòng tham, vụ lợi cá nhân dẫn đến tiêu cực, tham nhũng.
Theo ông Thông, tiêu cực, tham nhũng của một bộ phận cán bộ đe dọa đáng kể năng lực của Hải quan trong thực hiện hiệu quả nhiệm vụ của tổ chức; gian lận, gây thất thu thuế của nhà nước; cản trở thương mại quốc tế....
Hải quan Việt Nam đã đưa ra nhiều giải pháp phòng ngừa, ngăn chặn, chấn chỉnh, xử lý tình trạng gây phiền hà, sách nhiễu, tiêu cực, tham nhũng trong đội ngũ cán bộ, công chức Hải quan.
Trong đó, Hải quan sẽ tăng cường hình thức kiểm tra đột xuất, tập trung vào những đơn vị, những khâu nghiệp vụ trọng yếu, nhạy cảm dễ phát sinh tiêu cực để chủ động phát hiện, ngăn chặn, chấn chỉnh, xử lý kịp thời hành vi vi phạm của cán bộ, công chức.